停战以来已经过了三年的现在，被称为“战灾”的混乱仍然持续著的帝国。为了使帝国从战灾中振作起来，在军队里设置了专门对应的部门，就是帝国陆军情报部第3课（通称：陆情3课）以及实动小队“南瓜剪刀(Pumpkin Scissors)”。故事从亚里斯·L·马尔文少尉与蓝戴尔·欧兰多伍长在某个村子里相遇开始。

为了解开父亲死亡的谜团，流浪女子高中生——缠流子，一路追寻着唯一的线索“手持单片剪刀的女人”，转入了本能字学园。本能字学园中存在一种能够赋予穿着者特殊力量的“极制服”，而学生会会长鬼龙院皋月正是凭借着这种强大的力量以及绝对的恐怖统治着整个学园。掌握着“手持单片剪刀的女人”相关情报的皋月、想要向皋月打探出消息的流子——两个人的相遇究竟是偶然，抑或是必然！？学园中掀起的万丈波澜，将会在不断升级中席卷一切！